Lehenik eta behin, 3D inprimaketaren desabantaila handienetako bat kostua da. 3D inprimatzeko teknologian hasierako inbertsioa nahiko handia izan daiteke, batez ere goi mailako inprimagailuetarako. Gainera, 3D inprimaketan erabiltzen diren materialen kostua ere garestia izan daiteke. Etxeko erabiltzaileentzat, honek 3D inprimatzea merkean ez den zaletasun bilaka dezake.
Beste desabantaila handi bat 3D inprimaketaren abiadura da. Fabrikazio metodo tradizionalekin alderatuta, 3D inprimaketa prozesu motela izan daiteke. Hau bereziki egia da diseinu handiago eta konplexuagoetarako. Inprimatze-abiadura motel honek epe luzeagoak eta ekoizpen-egutegiak atzeratzea ekar dezake.
3D inprimaketaren hirugarren desabantaila erabil daitezkeen materialen barietate mugatua da. 3D inprimaketan erabil daitezkeen material motetan aurrerapen handia izan den arren, eskuragarri dauden materialen aukera fabrikazio-metodo tradizionalek baino askoz ere mugatuagoa da oraindik. Zenbait aplikaziotarako, hala nola, indar handia edo tenperatura erresistentzia behar duten produktuetarako, baliteke 3D inprimatzea aukerarik onena ez izatea.
Ondorioz, 3D inprimatzeak abantaila asko baditu ere, ez ditu eragozpenak. Kostua, abiadura, materialen barietate mugatua eta osasun-arrisku potentzialak dira kontuan hartu beharreko faktoreak 3D inprimaketa ekoizpen-metodo gisa aukeratzerakoan. Enpresek eta partikularrek 3D inprimaketaren alde onak eta txarrak aztertu behar dituzte euren beharretarako aukerarik onena den zehazteko.
